白菜、甘蓝和甘蓝型油菜PAP1/2同源基因的鉴定及分析
作者:陈道宗; 刘镒; 沈文杰; 朱博; 谭晨
关键词:
同源基因 保守结构域 花青素 R2R3-MYB转录因子 PAP1/2
发布时间:2022-04-16 05:02
PAP1/2转录因子是参与MBW复合体形成并调节花青素合成的主要转录因子。通过比较拟南芥PAP1/2转录因子核酸和蛋白序列,研究了调节小白菜、甘蓝和甘蓝型油菜花青素代谢的PAP1/2转录因子的确切同源性、进化关系和表达,并由Pfam证实,在甘蓝和甘蓝型油菜鉴定的PAP1/2转录因子的同源性分别为3、4和9。通过对PAP1/2转录因子同源拷贝所在片段的进化分析和微共线性分析,进一步阐明了PAP1/2转录因子不同拷贝之间的进化关系,通过分析甘蓝和甘蓝型油菜不同组织的转录组测序数据,阐明了A7和C6染色体不同拷贝的PAP1/2转录因子之间的关系,阐明了PAP1/2转录因子同源拷贝在不同组织中的表达。